AgriPheno订阅号推送文章汇编(2021年1月-2021年3月)

文章来源: | 2021-03-11

AgriPheno订阅号专注于持续更新植物生理生态、植物表型组学和基因组学、基因分型、智能化育种及应用、激光雷达探测技术及数据分析等领域,国内外最新资讯、战略与政策导读。本文节选了2021年1 -3月推送的代表性文章,以供大家参阅。

植物逆境研究
• 
基于图像的兵豆耐盐性高通量表型分析方法的开发与应用

本文介绍了一种用于兵豆耐盐性筛选的高通量表型分析方法的开发和应用。在初步研究中,使用LemnaTec Scanalyzer 3D表型分析平台采集的RGB图像对6种兵豆基因型进行了评估,以确定最佳的盐分水平和区分兵豆基因型的生长阶段。然后将优化后的方案应用于276份材料的筛选,这些材料也在常规表型筛选中进行了评估。

• “持续淬灭”帮助北方针叶树种度过寒冷的冬季

PSII到PSI的直接能量传递有了新证据。本文的发现为“持续淬灭”现象在北方森林中的常绿针叶树应对冬季寒冷条件的策略方面提供了合理的解释。

 

植物根系研究

• 根对土壤有机碳的影响:双刃剑

本文提出了一个新的、由微生物周转和土壤理化矩阵两个关联组分构成的Rhizo-Engine模型。该模型强调根系影响土壤有机碳动态是一把双刃剑,由根际沉积、根周转和植物吸收养分和水分三个方面驱动,通过稳定和不稳定机制加速SOC周转。

• 活性碳的频繁输入引起土壤有机物的强烈激发

频繁碳输入引起的巨大的SOM净损失,与β-葡萄糖苷酶、几丁质酶、酸性磷酸酶活性增加有关;频繁的碳输入使得真菌群落朝向K-策略真菌物种丰富度增加的方向转变。

• 植物类型主导细根C:N:P化学计量:中国的整合分析结果

本文基于地理信息、气候因子、土壤理化参数和植物类型,分析细根C:N:P化学计量的生物地理格局、气候因子和土壤理化参数对细根C:N:P化学计量的影响等。

 

植物表型研究方法/方案

• 基于深度学习的植物表型图像识别技术综述

本文比较和分析了植物表型图像识别的传统方法,解释了四种深度学习模型的理论及其在植物表型图像识别中的应用,讨论了植物表型图像识别中深度学习的难点和挑战以及未来的发展方向。

• 基于地基激光雷达点云的植被表型特征测量

本研究以加拿大一枝黄花为对象,对20株植株进行3个月室内培养,每月利用地基激光雷达扫描系统对实验植株进行多站扫描和点云融合,实现对植株生长过程的连续观测。

 

光谱技术

• 基于多光谱和X射线成像的种子质量自动表征方法

本文提出了一种基于多光谱和X射线成像技术相结合的种子质量自动表征方法。

• 高光谱成像估算小麦叶片N含量能力的评估

本文通过比较三台高光谱相机和一台非成像光谱仪,评估了高光谱成像和非成像传感器对小麦叶片中N含量的估算能力。

 

新观点/新技术

• 基于机器学习的谷类作物种子发芽检测、预测与质量评价

本文提出了一种基于机器学习的方法,该方法使用了具有候选区域的卷积神经网络(CNN),用于各种种子发芽实验的自动化和高通量评估。

 

植物生理生态研究

• 科学家发现活体中光系统I存在可变叶绿素荧光的证据

本研究结果为活体内存在可变PS I荧光Fv(I)提供了有力证据,这一证据是通过对绿藻和蓝藻稀悬浮液中强光诱导的长波和短波发射带(F>700和F<710)荧光产额变化的相对简单的比较测量获得的。

• 拟南芥动态类囊体堆叠和状态转换协同工作以避免光系统I受体侧限制

本文研究结果表明,在波动光条件下,状态转换和动态类囊体堆叠协同调控光合作用。

• DUAL-KLAS-NIR在水稻和蓝藻光合作用研究中的最新应用

PSI或围绕PSI的循环电子传递已然成为现在光合作用的研究热点。PSI供体侧(质蓝素PC)和受体测(铁氧还蛋白Fd)的研究越来越受关注。Dual-KLAS-NIR在藻类及作物光合作用研究中的应用日渐成熟。

• 针叶树利用不同的机制实现春季光合作用重新激活

为了在动态的季节性生长周期中保持光合作用捕获的光能和代谢需求之间的平衡,耐寒植物采用了两种主要策略来应对低温:(1)上调代谢库容量和/或(2)下调光化学效率,以平衡光合作用装置对光能的收集和利用。

• DUAL-KLAS-NIR监测C3植物中围绕PSI的环式电子传递

实现PS I及其供体侧和受体侧氧化还原动力学的同步测量,解构它们与光系统I的复杂相互作用,深入探究围绕PSI的环式电子传递。

• 加快光保护机制反而限制了拟南芥的生物量积累

改变光保护对植物生产性能(包括产量)的影响需要在其他(模式)物种中重现,然后才能被视为提高作物生产力的广泛有效策略。仅增强光合作用不足以提高作物产量,还需要同时提高其源库能力。

• 冬至安康丨双通道荧光仪DUAL-PAM-100的软件升级到V3.11啦!

软件升级后需要升级固件,软件和固件升级后无法退回旧版软件, 在新版软件View Mode下可以打开旧版软件测量的数据,查看并导出。

• 双通道荧光仪DUAL-PAM-100新软件功能更新Get PQ Pool Size

DUAL-PAM-100的软件已升级到最新的3.11版,新软件增加了Get(PQ)Poolsize的功能,现将新软件测试的过程和细节与大家分享。

 

人工智能/机器学习

• 综述:植物学与植物育种中的机器学习

本文综述了机器学习在植物学和植物育种中的应用,重点介绍了机器学习在生化水平、宏观水平上的应用,以及将基因型与表型联系起来的方法。

• 利用无人机图像和随机森林预测番茄的生物量和产量

采用随机森林机器学习方法,利用收获前采集的无人机RGB和多光谱图像数据,预测对照和盐处理植株的生物量和产量。

• 基于深度学习的计算机视觉在农业植物表型分析中的应用

本文旨在介绍基于深度学习的植物表型研究领域的进展以及有待进一步研究的问题。

 

其他

• 今日元宵佳节,AgriPheno祝您月圆人团圆!

一曲笙歌春如海,千门灯火夜似昼。AgriPheno祝您元宵节快乐,人月两圆!

• 新版光合作用文献数据库更新如期而至

新版光合作用文献数据库延用EndNote X9文献管理工具整理,收录了年周期20200210-20210226期间使用各型号PAM叶绿素荧光仪和GFS-3000光合仪发表的文章853篇。

• 今天除夕啦!AgriPheno祝您牛年大吉,阖家幸福!

喜辞旧岁,续写新程,辛丑牛年新春到来之际,AgriPheno祝您阖家幸福,喜乐安康!

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