AgriphenoTM高通量基因分型检测平台

AgriphenoTM高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。

Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA,通量达到800个样本/3小时。同时,适用于多种样本类型的DNA提取,包括植物叶片、种子,毛发、血方卡、精液、口拭子、唾液、组织等。提取的DNA适用于多种下游应用,如基因分型、一代测序、二代测序等。

Nexar高通量吸取样品DNA和引物、mix至384孔卷带并封膜。Soellex对封膜完成的卷带进行PCR水浴热循环,每次最多可达230,000个样本。Araya对水浴完成的卷带扫描分析,28秒扫描一张卷带。

AgriphenoTM基因分型采用KASP(Kompetitive Allele Specific PCR)原理,对目标SNPs和InDels进行精准的双等位基因分型。反应体系仅1.6μl,具有高通量、低成本,准确率和检出率接近100%的明显优势。

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                                                                                                             服务流程

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客户须提供 每个位点至少10个阳性对照。

服务周期 引物测试完成后,每批样品一周内出结果。

服务特点 高通量、低成本、快速准确。


应用案例

-牛毛基因分型

 

项目背景:牛奶里的蛋白有两种,酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的β酪蛋白分为A1和A2型。人在消化蛋白的时候,消化酶会在A1β酪蛋白67号位置一刀切,产生一种7个氨基酸的肽链(BCM-7),而无法切A2蛋白。BCM-7会导致许多人无法吸收牛奶中的营养成分,通常表现为喝奶后出现不同程度的胀气、腹痛、腹泻等胃肠不适现象。而A2型牛奶更易吸收。

A1, A2的区别是由奶牛的基因不同造成的,不同基因的奶牛会生产出含有不同蛋白质类型的牛奶。所以,需要检测奶牛的基因型用于奶牛育种。

项目目的:检测不同奶牛的SNP基因型(决定牛奶A1A2类型的位点)。



                                                                                               实验过程
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                    分型结果
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每个数据点代表一个独立的DNA样本的荧光信号,相同基因型的样本会发出相似水平的荧光,因此富集在一起。


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