模式植物拟南芥的表型研究

拟南芥(Arabidopsis thaliana)是十字花科拟南芥属植物,虽然没有经济价值,但具有生育周期短,植株个体小及基因组小等特点,因而长期以来一直被用来作为分子生物学和传统遗传学研究的模式实验材料,作为高等植物中具有最少基因组的物种,在科学研究中的地位也是极为重要的。

 

可见光表型参数提取

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紧密性(Compactness

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紧凑性根据植株旋转动量计算,不考虑植株大小,上图显示了紧凑性与叶面积的比较。紧凑性可以描述为叶片到形心距离的远近,比如叶柄的长度是其中一个参数。

 

旋转对称性(Rotational Symmetry

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偏心率(Excentricity

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表面覆盖率(Surface Coverage

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表面覆盖率是植株面积与可覆盖植株的圆面积的比值。此参数是为了提供一个值以显示植物覆盖在其生长区域的土壤上的密集程度。

 

面积/周长(Area/Circumference

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叶面积除以周长的比率可以允许对更多的形态性状进行分类。

 

两组植物区分应用(Application to Separate Two Groups

下面这个实例的目的是把两组植株区别开。这个方法用粗壮和紧凑性做为分离因子很好地区分了两组植株。

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近红外镜头成像表型数据分析

下图c为一株拟南芥植株冠层相对含水量分布图。

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