使用AgriPheno™平台的实验室版的高通量表型测量系统Scanalyzer HTS 近红外及可见光镜头进行成像。利用近红外下种子照片对应的灰度值不同反应相对含水量的分布情况。利用可见光成像，对种子形态以及种子净度等相关参数测定。通过出芽后种子的形态、大小以及颜色等表型的不同来分析种子的发芽率等相关参数。

1， 种子含水量分布（相对值）由近红外成像，分析软件对灰度值进行分析。灰度值高，含水量高；灰度值低。含水量低。

2，利用Lemna HTS得到单粒种子大小，可用来比较不同种子间的大小差异及正态分布关系。

3，HTS顶部可见光成像后，利用分析软件基于种子形态、大小筛选进行筛选。

4，基于种子出芽后形态与出芽前形态变化进行筛选。利用紧密度（与面积及长宽有关）、边界点圆度（出芽后该值会发生变化）。

5，基于种子出芽后芽的颜色与种子颜色不同进行筛选。

利用AgriPheno™平台的实验室版的高通量表型测量系统Scanalyzer HTS结合种子常用的一些处理方式，能够实现对单粒种子表型特征的高通量精准测量；同时可以无损测量的同时获得其他测量方法无法获得的参数，比如种子含水量。